患者也會感覺脾氣暴躁、情緒波動及抑鬱，患上睡眠窒息症的青少年的學業成績也會受到不良的影響，甚至會出現行為問題。

在國際疾病分類臨床修正第九版準則下找出1998年至2001年的資料中患有睡眠窒息症及各種精神疾病的病人紀錄。接著，對比了有睡眠窒息症和沒有睡眠窒息症的退伍軍人的年齡、性別、種族及不同的精神疾病的患病率。

平均年齡為57.6歲的4,060,504個案中，發現有118,105個人患有睡眠窒息症（患病率約2.91％）。在睡眠窒息症患者當中診斷出有情緒病的包括抑鬱症 (21.8%)、焦慮症 (16.7%)、創傷後遺症 (11.9%)、思覺失調 (5.1%)和雙相情感障礙 （躁狂抑鬱症）(3.3%)。相對於沒有睡眠窒息症的病人，有睡眠窒息症的患者較易患上情緒障礙、焦慮症、創傷後遺症、思覺失調及癡呆。

總括而言，患有睡眠窒息症的退伍軍人有較高的情緒病患病率。這提示著病人若果患上情緒病以及同時出現睡眠呼吸障礙的徵狀時，應評估睡眠窒息症的可能性。

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